通常，實驗所用的物質很多都帶有毒性，所以通風柜的各個部位和與通風柜關聯的通風管道里有著非常大的安全隱患。因此在實驗前，排除危險因素尤為重要。
所有的檢查的工作人保養員都必須穿著防護裝備，比如口罩，防護面具，防護眼鏡，耐酸堿手套等）。在實驗的過程當中，如果出現危險的狀況，我們必須在排除危險以后，才可以繼續對通風柜進行檢查。為了保障實驗室人員的生命安全，和延長通風柜的使用壽命，排氣系統必須保持正常運作的狀態。
我們應每3個月使用中性清潔劑清潔刷洗柜內各部，包含玻璃視窗、內襯板及導流板內外；潤滑調節門之滑軌、拉索及平衡滑輪。每6個月檢視調節機械裝置是否有腐蝕或損壞；檢視各風扇、馬達、轉軸及軸承是否運轉正常；測試各遙控裝罝（水龍頭，氣體拷克）是否可正常運作；檢視排氣出口管路特別是排氣罩與管路連接部份是否有泄漏現象；檢查排氣罩內部，特別是彎管部是否有雜質堆積。當檢查出不正常的現象時，應立即依規格更換損壞的或不良的零配件，任何時候只要發現有化學液體濺出時就必須馬上以中性清潔劑清潔。
通風柜臺面雖然耐高溫，但還是不能長時間與明火、高溫直接接觸。使用電爐時，需加石棉墊板或三角支架隔熱。通風柜臺面雖對各種化學品均具有良好之抗蝕性，但長時間浸澤接觸，亦可能產生很多影響，所以若有化學品滴落臺面時，應盡快予以清除。
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